ჩოხატაურის ყველაზე განსაკუთრებული ჰიდრო-ელემენტებია მინერალური წყაროები, რომლებიც კარბონატ-კალციუმის შემცველი ქვებიდან გამოდის. ამ წყაროების ნაწილი ბებოების მეხსიერებაში „სასმელი წყაროს" სახელით ცნობილია — ადგილობრივები მათ სამკურნალო თვისებებს მიაწერდნენ.
ჩანჩქერები უმეტესად სეზონური ხასიათის ა — გაზაფხულის ნალექის პიკში წარმოქმნილი, ზაფხულის ბოლოს ჩმახავი. თუმცა ბახმარო-ჩოხატაური გზაზე რამდენიმე მუდმივი ჩანჩქერია, რომელიც ყოველ სეზონში ინარჩუნებს ნაკადს.
ჩოხატაურის ისტორიული სარწყავი სისტემა ნაწილობრივ დღესაც მოქმედია. ქვის და ხის არხები, ჯებირები, ჭები — ეს ინფრასტრუქტურა XVIII–XIX საუკუნეებში შენდებოდა და ჯერ კიდევ ემსახურება ზოგიერთ სასოფლო-სამეურნეო კულტურას.